MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 48690

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_021738	GAAATG	2	12	2491164	2491175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48502	NC_021738	ATT	2	6	2491386	2491391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48503	NC_021738	CGG	2	6	2491405	2491410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48504	NC_021738	CAG	2	6	2491425	2491430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48505	NC_021738	TAT	2	6	2491523	2491528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48506	NC_021738	CCT	2	6	2491531	2491536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48507	NC_021738	ACG	2	6	2491577	2491582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48508	NC_021738	AAG	2	6	2491630	2491635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48509	NC_021738	CCG	2	6	2491673	2491678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48510	NC_021738	AG	3	6	2491748	2491753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48511	NC_021738	TTG	2	6	2491834	2491839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48512	NC_021738	GC	3	6	2491847	2491852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48513	NC_021738	GCT	2	6	2491866	2491871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48514	NC_021738	CAG	2	6	2491883	2491888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48515	NC_021738	ACA	2	6	2491916	2491921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48516	NC_021738	CAA	2	6	2491983	2491988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48517	NC_021738	CAAA	2	8	2492021	2492028	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48518	NC_021738	TTG	2	6	2492092	2492097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48519	NC_021738	CAA	2	6	2492223	2492228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48520	NC_021738	A	6	6	2492235	2492240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48521	NC_021738	CAA	2	6	2492307	2492312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48522	NC_021738	TGG	2	6	2492317	2492322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48523	NC_021738	A	6	6	2492356	2492361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48524	NC_021738	AGC	2	6	2492374	2492379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48525	NC_021738	GTG	2	6	2492503	2492508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48526	NC_021738	TAT	2	6	2492513	2492518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48527	NC_021738	ATA	2	6	2492541	2492546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48528	NC_021738	AGT	2	6	2492552	2492557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48529	NC_021738	T	6	6	2492561	2492566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48530	NC_021738	ATT	2	6	2492601	2492606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48531	NC_021738	GTT	2	6	2492644	2492649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48532	NC_021738	TGA	2	6	2492890	2492895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48533	NC_021738	ATG	2	6	2492907	2492912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48534	NC_021738	ATA	2	6	2492989	2492994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48535	NC_021738	AG	3	6	2493050	2493055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48536	NC_021738	ACAA	2	8	2493083	2493090	75 %	0 %	0 %	25 %	525657946
48537	NC_021738	AGG	2	6	2493121	2493126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525657946
48538	NC_021738	CTT	2	6	2493191	2493196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657946
48539	NC_021738	TAT	2	6	2493230	2493235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657946
48540	NC_021738	TTC	2	6	2493273	2493278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657946
48541	NC_021738	CTTGA	2	10	2493332	2493341	20 %	40 %	20 %	20 %	525657946
48542	NC_021738	GA	3	6	2493382	2493387	50 %	0 %	50 %	0 %	525657946
48543	NC_021738	TAC	3	9	2493417	2493425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657946
48544	NC_021738	A	6	6	2493426	2493431	100 %	0 %	0 %	0 %	525657946
48545	NC_021738	TCA	2	6	2493447	2493452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657946
48546	NC_021738	TTC	2	6	2493528	2493533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657946
48547	NC_021738	GAT	2	6	2493637	2493642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657946
48548	NC_021738	GTT	2	6	2493697	2493702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657946
48549	NC_021738	TGA	2	6	2493715	2493720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657946
48550	NC_021738	AAACA	2	10	2493721	2493730	80 %	0 %	0 %	20 %	525657946
48551	NC_021738	AGT	2	6	2493882	2493887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657946
48552	NC_021738	ACCA	2	8	2493915	2493922	50 %	0 %	0 %	50 %	525655723
48553	NC_021738	CAG	2	6	2493935	2493940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655723
48554	NC_021738	TTA	2	6	2493970	2493975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655723
48555	NC_021738	CT	3	6	2493983	2493988	0 %	50 %	0 %	50 %	525655723
48556	NC_021738	CGG	2	6	2494146	2494151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655723
48557	NC_021738	A	6	6	2494176	2494181	100 %	0 %	0 %	0 %	525655723
48558	NC_021738	TCAGAC	2	12	2494278	2494289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525655723
48559	NC_021738	TGA	2	6	2494323	2494328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655723
48560	NC_021738	A	7	7	2494336	2494342	100 %	0 %	0 %	0 %	525655723
48561	NC_021738	CT	3	6	2494411	2494416	0 %	50 %	0 %	50 %	525655723
48562	NC_021738	T	6	6	2494656	2494661	0 %	100 %	0 %	0 %	525655723
48563	NC_021738	TGA	3	9	2494788	2494796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655723
48564	NC_021738	TC	3	6	2494943	2494948	0 %	50 %	0 %	50 %	525655723
48565	NC_021738	CT	3	6	2494996	2495001	0 %	50 %	0 %	50 %	525655723
48566	NC_021738	AAC	2	6	2495021	2495026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655723
48567	NC_021738	ATG	2	6	2495123	2495128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655723
48568	NC_021738	ACTT	2	8	2495187	2495194	25 %	50 %	0 %	25 %	525655723
48569	NC_021738	AACA	2	8	2495241	2495248	75 %	0 %	0 %	25 %	525655723
48570	NC_021738	A	6	6	2495281	2495286	100 %	0 %	0 %	0 %	525657947
48571	NC_021738	TAG	2	6	2495372	2495377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657947
48572	NC_021738	AT	3	6	2495387	2495392	50 %	50 %	0 %	0 %	525657947
48573	NC_021738	GAT	2	6	2495462	2495467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657947
48574	NC_021738	TCG	3	9	2495480	2495488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525657947
48575	NC_021738	CGT	2	6	2495517	2495522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525657947
48576	NC_021738	GGT	2	6	2495553	2495558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525657947
48577	NC_021738	TTGA	2	8	2495700	2495707	25 %	50 %	25 %	0 %	525657947
48578	NC_021738	GAA	2	6	2495780	2495785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525657947
48579	NC_021738	TAT	2	6	2495843	2495848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657947
48580	NC_021738	TAA	2	6	2495864	2495869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525657947
48581	NC_021738	TTA	2	6	2495952	2495957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657947
48582	NC_021738	TAA	2	6	2495966	2495971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525657947
48583	NC_021738	A	7	7	2496183	2496189	100 %	0 %	0 %	0 %	525657947
48584	NC_021738	ACA	2	6	2496200	2496205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657947
48585	NC_021738	A	6	6	2496226	2496231	100 %	0 %	0 %	0 %	525657947
48586	NC_021738	ATCAA	2	10	2496238	2496247	60 %	20 %	0 %	20 %	525657947
48587	NC_021738	AAC	2	6	2496259	2496264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657947
48588	NC_021738	AGC	2	6	2496266	2496271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525657947
48589	NC_021738	AAAT	2	8	2496299	2496306	75 %	25 %	0 %	0 %	525657947
48590	NC_021738	TGA	2	6	2496338	2496343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657947
48591	NC_021738	GAT	2	6	2496351	2496356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657947
48592	NC_021738	ATT	2	6	2496416	2496421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657947
48593	NC_021738	TC	3	6	2496452	2496457	0 %	50 %	0 %	50 %	525657947
48594	NC_021738	ACTT	2	8	2496536	2496543	25 %	50 %	0 %	25 %	525657947
48595	NC_021738	AG	3	6	2496641	2496646	50 %	0 %	50 %	0 %	525657947
48596	NC_021738	TGT	2	6	2496674	2496679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657947
48597	NC_021738	ATTC	2	8	2496754	2496761	25 %	50 %	0 %	25 %	525657947
48598	NC_021738	ACAG	2	8	2496773	2496780	50 %	0 %	25 %	25 %	525657947
48599	NC_021738	TGA	2	6	2496836	2496841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657947
48600	NC_021738	TCA	2	6	2496890	2496895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657947
48601	NC_021738	AGG	2	6	2496899	2496904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525657947
48602	NC_021738	A	6	6	2496905	2496910	100 %	0 %	0 %	0 %	525657947
48603	NC_021738	ATTG	2	8	2496939	2496946	25 %	50 %	25 %	0 %	525657948
48604	NC_021738	AAG	2	6	2496968	2496973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525657948
48605	NC_021738	ATCC	2	8	2496979	2496986	25 %	25 %	0 %	50 %	525657948
48606	NC_021738	AAC	2	6	2497013	2497018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657948
48607	NC_021738	AAT	2	6	2497030	2497035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525657948
48608	NC_021738	TGA	2	6	2497044	2497049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657948
48609	NC_021738	TGT	2	6	2497071	2497076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657948
48610	NC_021738	TTG	2	6	2497120	2497125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657948
48611	NC_021738	CAA	2	6	2497147	2497152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657948
48612	NC_021738	ATT	2	6	2497159	2497164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657948
48613	NC_021738	ATT	2	6	2497173	2497178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657948
48614	NC_021738	GAA	2	6	2497264	2497269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525657948
48615	NC_021738	AGC	2	6	2497284	2497289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525657948
48616	NC_021738	TGA	2	6	2497296	2497301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657948
48617	NC_021738	AAG	2	6	2497367	2497372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525657948
48618	NC_021738	A	6	6	2497466	2497471	100 %	0 %	0 %	0 %	525657948
48619	NC_021738	TCTAT	2	10	2497524	2497533	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48620	NC_021738	TAT	2	6	2497577	2497582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48621	NC_021738	GA	3	6	2497630	2497635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48622	NC_021738	CAG	2	6	2497645	2497650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525657949
48623	NC_021738	T	6	6	2497682	2497687	0 %	100 %	0 %	0 %	525657949
48624	NC_021738	CAAC	2	8	2497690	2497697	50 %	0 %	0 %	50 %	525657949
48625	NC_021738	TTA	2	6	2497718	2497723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657949
48626	NC_021738	TCCT	2	8	2497807	2497814	0 %	50 %	0 %	50 %	525657949
48627	NC_021738	TGT	2	6	2497833	2497838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657949
48628	NC_021738	AGT	2	6	2497876	2497881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657949
48629	NC_021738	TTTA	2	8	2497893	2497900	25 %	75 %	0 %	0 %	525657949
48630	NC_021738	TG	3	6	2497926	2497931	0 %	50 %	50 %	0 %	525657949
48631	NC_021738	TGA	2	6	2497942	2497947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657949
48632	NC_021738	ATG	2	6	2497983	2497988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657949
48633	NC_021738	TC	3	6	2498032	2498037	0 %	50 %	0 %	50 %	525657949
48634	NC_021738	TTA	2	6	2498073	2498078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657949
48635	NC_021738	TC	3	6	2498139	2498144	0 %	50 %	0 %	50 %	525657949
48636	NC_021738	CAA	3	9	2498186	2498194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657949
48637	NC_021738	CAA	2	6	2498243	2498248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657949
48638	NC_021738	TGA	2	6	2498284	2498289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657949
48639	NC_021738	A	6	6	2498300	2498305	100 %	0 %	0 %	0 %	525657949
48640	NC_021738	ACTT	2	8	2498373	2498380	25 %	50 %	0 %	25 %	525657949
48641	NC_021738	TGTAC	2	10	2498398	2498407	20 %	40 %	20 %	20 %	525657949
48642	NC_021738	TA	3	6	2498415	2498420	50 %	50 %	0 %	0 %	525657949
48643	NC_021738	TAA	2	6	2498422	2498427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525657949
48644	NC_021738	GTACT	2	10	2498428	2498437	20 %	40 %	20 %	20 %	525657949
48645	NC_021738	CAA	2	6	2498561	2498566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657949
48646	NC_021738	ATT	2	6	2498570	2498575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657949
48647	NC_021738	CTA	2	6	2498653	2498658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657949
48648	NC_021738	AGA	2	6	2498665	2498670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525657949
48649	NC_021738	TTC	2	6	2498886	2498891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657950
48650	NC_021738	TAAA	2	8	2499005	2499012	75 %	25 %	0 %	0 %	525657950
48651	NC_021738	GCA	2	6	2499132	2499137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525657950
48652	NC_021738	TTG	2	6	2499203	2499208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657950
48653	NC_021738	CAC	2	6	2499292	2499297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525657950
48654	NC_021738	TCT	2	6	2499309	2499314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657950
48655	NC_021738	GAT	2	6	2499415	2499420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657950
48656	NC_021738	CCT	2	6	2499444	2499449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525657950
48657	NC_021738	ACTC	2	8	2499485	2499492	25 %	25 %	0 %	50 %	525657950
48658	NC_021738	TCA	2	6	2499552	2499557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657950
48659	NC_021738	T	6	6	2499564	2499569	0 %	100 %	0 %	0 %	525657950
48660	NC_021738	ACC	2	6	2499611	2499616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525657950
48661	NC_021738	TTG	2	6	2499629	2499634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657950
48662	NC_021738	TTC	2	6	2499698	2499703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657950
48663	NC_021738	TAA	2	6	2499713	2499718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525657950
48664	NC_021738	GTT	2	6	2499743	2499748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657950
48665	NC_021738	GATT	2	8	2499781	2499788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48666	NC_021738	TCT	2	6	2499854	2499859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48667	NC_021738	GACA	2	8	2499887	2499894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48668	NC_021738	TCT	2	6	2499933	2499938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48669	NC_021738	TATC	2	8	2499948	2499955	25 %	50 %	0 %	25 %	525657951
48670	NC_021738	TCA	2	6	2500013	2500018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657951
48671	NC_021738	TG	3	6	2500090	2500095	0 %	50 %	50 %	0 %	525657951
48672	NC_021738	TTC	2	6	2500122	2500127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525657951
48673	NC_021738	TTG	2	6	2500224	2500229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657951
48674	NC_021738	TCA	2	6	2500331	2500336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657952
48675	NC_021738	TGT	2	6	2500367	2500372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657952
48676	NC_021738	CT	3	6	2500379	2500384	0 %	50 %	0 %	50 %	525657952
48677	NC_021738	AAC	2	6	2500420	2500425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657952
48678	NC_021738	TTG	2	6	2500453	2500458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525657952
48679	NC_021738	ATC	2	6	2500519	2500524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657952
48680	NC_021738	AAC	2	6	2500564	2500569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525657952
48681	NC_021738	CTGAGT	2	12	2500582	2500593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525657952
48682	NC_021738	GT	3	6	2500690	2500695	0 %	50 %	50 %	0 %	525657952
48683	NC_021738	GAG	2	6	2500728	2500733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525657952
48684	NC_021738	CTG	2	6	2500770	2500775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525657952
48685	NC_021738	TCA	2	6	2500892	2500897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525657952
48686	NC_021738	AGCGGT	2	12	2500930	2500941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525657952
48687	NC_021738	GCCCAA	2	12	2500965	2500976	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525657952
48688	NC_021738	GAG	2	6	2501110	2501115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525657952
48689	NC_021738	GATA	2	8	2501269	2501276	50 %	25 %	25 %	0 %	525657952
48690	NC_021738	A	6	6	2501309	2501314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...86878889909192939495969798Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.